Используйте этот метод:
URL url = new URL(getCodeBase().getProtocol(),
getCodeBase().getHost(),
getCodeBase().getPort(),
"/your_pdf_file");
getAppletContext().showDocument(url);
Было бы просто предложить пользователю загрузить файл или просмотреть его встроенным
РЕДАКТИРОВАТЬ: Это полезно, только если сервер генерирует PDF, а не клиентский апплет