Вы действительно не можете контролировать то, что происходит в iframe.
Но если вы хотите быть немного умнее, вы можете поместить элементы непосредственно над iframe, например, div или прозрачный холст или все, что вы хотите,это отлавливает все события, так что пользователь просто не может нажать на iframe.
Не самый идеальный, это означает, что пользователи не могут нажимать кнопки на видео YouTube, но это, вероятно, ваш единственный реальный вариант.