После долгих исследований я обнаружил, что это простая проблема, связанная с тем, что упаковщику не хватает памяти, это связано с тем, что git использует методы сжатия, которые больше подходят для большого количества небольших файлов.
Если кому-то было интересно, я решаю эту проблему, разбивая файлы перед тем, как добавить их, чтобы они все еще могли отслеживать изменения, но их нужно будет собрать при получении.