Причина, по которой ваш инструмент блокирует файл, заключается в том, чтобы предотвратить изменение файла во время его резервного копирования. Например, если вы начали резервное копирование, но на полпути в СУБД (например, SQL Server) решили внести изменения в файл, то ваша резервная копия будет повреждена.
Я рекомендую вам использовать инструменты, поставляемые с вашими решениями для баз данных, для выполнения резервного копирования. Другой вариант - остановить базу данных перед ее резервным копированием.