как я могу изменить цвет фокуса / нарисовать в WebView через Java или XML, который виден на экране ниже (оранжевая вещь вокруг ссылки)?
Боюсь, ты не сможешь этого сделать. Это стиль фокусировки по умолчанию, установленный на телефоне. это может быть изменено только самим сайтом с использованием стилей CSS.