Если вы создаете, например, таймер на 1 мс, но из-за различных задержек он генерирует, например, 4,5 мс из генерируемого сигнала, пока он фактически не будет принят приложением, за это время могло бы быть 3 больше сигналов, выпущенных за это время (но , поскольку только один сигнал ожидает в данный момент). timer_getoverrun() возвращает значение 3 - количество сигналов не сгенерированных.