var f = document.getElementById("myHiddenFieldId");
if (f) {
f.value = myVar;
}
Обязательно используйте этот скрипт при загрузке страницы или в блоке скрипта где-то под скрытым полем. Также убедитесь, что ваш внешний js-файл загружен, поэтому обработчик onload будет самым безопасным местом.
ОБНОВЛЕНИЕ: Использование jQuery
jQuery(document).ready(function() {
jQuery("#myHiddenFieldId").val(myVar);
});
ОБНОВЛЕНИЕ: в вашем конкретном случае вы можете попробовать с
var value = dragtable.readCookie("dragtable-" + "myTableId");
if (value) {
jQuery("#myHiddenFieldId").val(value);
}