Это будет работать в версии 1.3:
$('#foo').fadeOut(function() {
if (! $.support.opacity) {
this.style.removeAttribute('filter');
}
});
В более ранних версиях вам нужно было бы сделать:
$('#foo').fadeOut(function() {
if ($.browser.msie) {
this.style.removeAttribute('filter');
}
});