используйте : четные , : нечетные селекторы
$("#container> div:even").css({'background-color':'Green'});
чтобы проверить, содержит ли div 50%
, используйте селектор contains
$("#container> div:contains(50%):even").css({'background-color':'Green'});
ОБНОВЛЕНИЕ: недостающая часть
$("#container> div").filter(function(){
var val = $("span",this).text();
var i = val.substring(0,2);
console.log(i);
if(i>50)return $(this);
}).filter(':even').css({'background-color':'Green'});