Вы можете сохранить свой файл на сервере как ..
FileUpload1.SaveAs(Server.MapPath("~/temp/xyz.xlsx"));
, а затем установить его в строке подключения как ..
connectionString = "Provider=Microsoft.ACE.OLEDB.12.0;Data Source=" + Server.MapPath("~/temp/xyz.xlsx"); Extended Properties=Excel 12.0;";