Пока ваш простой HTML-элемент является дочерним для контейнера, а указанный контейнер имеет относительное или абсолютное позиционирование, вы можете его снять.
http://www.w3schools.com/cssref/pr_class_position.asp
Редактировать: Так как ваша реальная цель - это пользовательское позиционирование. Просто используйте возможность разработчика, предоставленную в библиотеке, вручную позиционировать модал. Это прямо из документации.
// Manually set position using percentages
$("#sample").modal({position: ["50%","50%"]});
Чтобы правильно расположить его, вам просто нужно получить смещение элемента, над которым вы хотите расположить, выше, ниже, рядом с и т.д. ... и выполнить простую математику, а затем вызвать установить позицию, как показано выше .
Вы можете получить смещение любого элемента, например, так:
var os = $('#selector').offset();
var top = os.top;
var left = os.left;
http://api.jquery.com/offset/
Смещение относительно всего документа, поэтому я считаю, что оно удовлетворит ваши потребности в фиксированном позиционировании.