Да, CQWP включен только для сайтов публикации.
Описанный вами метод в порядке, но не ожидайте, что какие-либо функции публикации будут работать в восстановленном шаблоне.Например, вы могли создавать страницы на основе какого-то макета страницы.Эти страницы могут быть повреждены в восстановленном шаблоне, поскольку макеты страниц являются функцией публикации.