Используйте третий параметр view () и вставьте результат в другую строку. Наконец, напечатайте эту строку, как вам нравится:
$FinalOutput = "";
$FinalOutput .= $this->load->view('admin/fees/coursedetails',$data, true);
$FinalOutput .= $this->load->view('admin/fees/coursereport',$data, true);
Наконец, в конце вашего скрипта:
$this->load->view('admin/fees/template',array('output' => $FinalOutput));
UPDATE
Я вижу, что вы обновили свой вопрос. Если вышеупомянутое не то, что вы ищете, возможно, это:
if( $data['title'] == 'Detail')
$this->load->view('admin/fees/coursedetails',$data);
else
$this->load->view('admin/fees/coursereport',$data);
Идея в том, чтобы проверить, какой вид вы действительно хотите. Это то, что вам нужно?