Добавьте 'this' к вызывающей функции:
<td style="text-align:center">
<input type="checkbox"
name="checkbox_{{ word.id }}"
onclick="highlight_row('row_{{ forloop.counter }}',this)" />
</td>
Теперь вы можете использовать проверенное состояние чечбокса, чтобы определить, что делать:
function highlight_row(row_id,checkbox)
{
var row = document.getElementById(row_id);
row.style.background = checkbox.checked ? "yellow" : "";
}