Я не уверен, что он отвечает на ваш вопрос, но вот как я бы реализовал элементарную TreeForm:
decompose[expr_?AtomQ] := expr
decompose[expr_] := Block[{lev = Level[expr, {1}]},
Sow[Thread[expr -> lev]]; decompose /@ lev;]
treeForm[expr_] := Reap[decompose[expr]][[-1, 1]] // Flatten
Тогда:

EDIT
Да, вы правы, это не дерево. Чтобы сделать его деревом, каждое выражение должно иметь свою позицию. Вроде как так:
ClearAll[treePlot, node, decompose2];
SetAttributes[{treePlot, node, decompose2}, HoldAll];
decompose2[expr_] /; AtomQ[Unevaluated[expr]] := node[expr];
decompose2[expr_] := Module[{pos, list},
pos = SortBy[
Position[Unevaluated[expr], _, {0, Infinity}, Heads -> False],
Length];
list = Extract[Unevaluated[expr], pos, node];
list = MapThread[Append, {list, pos}];
ReplaceList[
list, {___, node[e1_, p1_], ___, node[e2_, p2_], ___} /;
Length[p2] == Length[p1] + 1 &&
Most[p2] == p1 :> (node[e1, p1] -> node[e2, p2])]
]
Тогда
treePlot2[expr_] :=
Module[{data = decompose2[a^2 + Subscript[b, 2] + 3 c], gr, vlbls},
gr = Graph[data];
vlbls = Table[vl -> (HoldForm @@ {vl[[1]]}), {vl, VertexList[gr]}];
Graph[data, VertexLabels -> vlbls, ImagePadding -> 50]
]
