вы можете запустить javascript для чтения данных и вставить их в тег html, а затем прочитать значение тега html:
JavascriptExecutor executor = (JavascriptExecutor) driver;
executor.executeScript("var y = Highcharts.charts[0].series[0].data[0].y;$('body').append('<span id=\"testTag\">'+y+'</span>');");
WebElement y = driver.findElement(By.xpath("//span[@id='testTag']"))