MOCs - это всего лишь блокнот, с помощью которого вы можете создавать, обновлять, удалять и извлекать NSManagedObjects.
Если у вас есть два объекта в результате операции сохранения - это означает, что вы по ошибке создали две сущности, которые были сохранены при слиянии.
Не могли бы вы показать нам код, в котором вы создаете объект?