Не похоже, что существует какой-либо поддерживаемый способ совместного использования SqlCipher и Coreiteata, поддерживаемых SQLite.
Следует отметить, что на современных устройствах iOS все флэш-накопители по умолчанию зашифрованы. Это обеспечит защиту от автономных атак, а добавление PIN-кода на ваше устройство iOS защитит от активных атак. Есть ли какая-то конкретная причина, по которой вам нужно использовать SqlCipher, который не распространяется на шифрование всего диска?