Вы не должны предполагать, что у пользователя есть IE.
Некоторые приложения можно запускать из браузера (если они установлены пользователем). Например, itunes: //, ftp: // и т. Д.
Чтобы ответить на ваш оригинальный вопрос, нет, вы не можете. Было бы опасно для безопасности, если бы вы могли произвольно запускать приложения на компьютере пользователя.