Плохая маршрутизация сломает другие маршруты.Это не то, что вы можете оставить третьим сторонам.
Однако вы можете заставить их определять маршрут всегда с фиксированным маршрутом верхнего уровня.Например:
/ThirdParty1/{controller}/{id}
/ThirPdarty1/{Section}/{controller}/{id}
И
/ThirdParty2/{controller}/{area}/{id}