Вам следует переключиться на PIE.htc (см. http://css3pie.com/).. Это более новая и значительно улучшенная альтернатива старому используемому вами файлу HTMLRemix HTC. В нем используются те же базовые технологии, но больше функций и производительность. Кроме того, он находится в стадии активной разработки, и если с ним возникают проблемы, автор очень отзывчив на них.
Есть очень хорошее изменение, что CSS3Pie решит ваши проблемы.
Если у вас все еще есть проблемы, есть некоторые распространенные проблемы при работе с IE с такими вещами. Самым большим является то, что в элементах IE должен быть запущен флаг «addLayout», чтобы эти программы HTC работали правильно. Это специфический для IE сбой; попробуйте добавить стили position:relative; или zoom:1; к затронутым элементам и посмотрите, поможет ли это. На сайте CSS3Pie есть страница «Общие проблемы», на которой эти вопросы рассматриваются более подробно; почему так происходит и как с ними бороться.
Надеюсь, это поможет. :)