Нет, pdfminer не поддерживает редактирование.
Однако это может быть намного проще, если вы не пытаетесь изменить pdf, а вместо этого используете PDFOpenParameters: http://partners.adobe.com/public/developer/en/acrobat/PDFOpenParameters.pdf
Вы можете использовать идентификаторы фрагментов URL, например:
http://www.example.com/test.pdf#search=foo
Или даже при открытии Acrobat в командной строке (пример Windows)
AcroRd32.exe /A "search=foo" test.pdf
Вы также можете открыть PDF определенную страницу,и выделите определенную область этой страницы (но не разные области на разных страницах одновременно).
(хорошо, я знаю, что это не совсем решение для вашего вопроса, но если этого достаточно дляваши потребности, это много проще)