Попробуйте использовать Open XML SDK для чтения и записи документов Excel.Он может читать и записывать документы, совместимые с Office 2007 и 2010, без необходимости установки Excel на компьютер / сервер.Другим подходом может быть автоматизация Excel (создание экземпляра объекта Excel.Application, а затем программный запуск Excel для выполнения работы).
Обычно я рекомендую вариант 1.