У меня тоже была эта проблема, и я обнаружил, что если я открыл Блокнот как Администратор, а затем открыл файл конфигурации, я мог сохранить изменения, пока служба была установлена и остановлена.Если у вас есть настраиваемые разделы конфигурации, вы, вероятно, захотите убедиться, что ваша служба перезагружает их в OnStart.