Неа. Подмодуль будет клонировать весь репозиторий, на который он указывает. Также вы не можете удалять какие-либо папки из подмодуля, поэтому нет возможности изменить его после включения.
Там, где я работаю, мы обнаружили, что модули - это довольно больно. Каждый раз, когда вы перераспределяете (в зависимости от вашего метода), вам нужно просмотреть каждый подмодуль и заново его инициализировать / добавить. Мы пытались использовать его для наших дополнений с открытым исходным кодом, таких как tinymce и tcpdf, но использовали этот метод.