У меня была такая же проблема из-за ошибки в Visual Studio 2013 (VS 2013) в сочетании с инструментом TFS. TFS-проект не подключается и не запускается, когда находит локальный .git-проект, который вы добавили ранее.
Сначала закройте VS 2013, а затем переименуйте файл .git в другой постфикс (например, «test.gitRENAMED»). Это делает подключение к TFS-проектам снова доступным при следующем запуске VS 2013.
Чтобы избежать испорченного локального git-репозитория, назовите впоследствии файл .git.
К сожалению, Windows-проводник не позволяет вам называть каталог обратно «.git» из-за их политики каталогов пользователя.
Просто переименуйте папку на компьютере с Linux или с помощью Windows-Explorer-Tool "Total Commander" назад.