Чтобы удалить этот вопрос из списка без ответа ... При запуске нового проекта в CUDA, я рекомендую использовать простой make-файл, а не подход "common.mk" из CUDA SDK.
В будущем NVIDIA упростит SDK и, надеюсь, предоставит простой шаблонный файл сборки.