В логе четко указано, что ваш скрипт выполняется, даже если он не показывает желаемого эффекта. Я ожидаю, что procmail зарегистрирует ошибку, если выполнение не удалось.
В любом случае, убедитесь, что пользователь (uid), с которым выполняется procmail, имеет правильные разрешения для выполнения вашего скрипта. Подключите скрипт к procmail, только если вы успешно протестировали что-то вроде этого (замените procmail на правильный uid):
# sudo -u procmail /bin/sh -c '/bin/cat /work/scripts/mail.txt | /usr/bin/python /work/scripts/privilege_emails_forward.py'
В зависимости от конфигурации sudo, вам придется запускать это как root. Да, и убедитесь, что вы используете абсолютные пути к файлам.