Спасибо за ответы. Как оказалось, проблема была в сценарии, который использовался для фактического вызова ./configure. В самом скрипте было дополнительное пространство над флагом конфигурации bindir. Итак ...
'- exec-prefix = / usr' \ _ <- дополнительный пробел, указанный подчеркиванием. <br>
'--bindir = / usr / bin' \
Значит, escape-символ выходил из пробела, а не возврата.
Errr.
Надеюсь, это поможет кому-то еще потерять день, пытаясь копнуть глубже, чем очевидное.