Если служба WCF размещена в IIS ASP.NET, вы можете использовать Application_Start в Global.asax для запуска других служб.
Если вы размещаете службу WCF в консольном приложении или службе Windows, то, конечно, именно здесь вы должны вызывать код для запуска этих внешних служб.