С jQm это именно то, что происходит при прокрутке.Попробуйте поискать некоторые виджеты jQm, которые будут дополнять инфраструктуру jQm.Я думаю iScroll 4 делает то, что вы ищете здесь.
Что касается фиксированного позиционирования, по ссылке, которую вы указали в исходном вопросе:
Фиксированные панели инструментов
В браузерах, поддерживающих положение CSS: фиксированные (как правило, большинство браузеров для настольных компьютеров, iOS5 +, Android 2.2+, BlackBerry 6 и более), панели инструментов, использующие плагин "fixedtoolbar", будут зафиксированы наверх или низ окна просмотра, а содержимое страницы свободно прокручивается между ними.В браузерах, которые не поддерживают фиксированное позиционирование, панели инструментов возвращаются к статическому встроенному позиционированию на странице.
Чтобы включить это поведение в верхнем или нижнем колонтитуле, добавьте атрибут data-position = "fixed"к элементу верхнего или нижнего колонтитула jQuery Mobile.
Пример фиксированной разметки заголовка:
<div data-role="header" data-position="fixed">
<h1>Fixed Header!</h1>
</div>
Пример фиксированной разметки нижнего колонтитула:
<div data-role="footer" data-position="fixed">
<h1>Fixed Footer!</h1>
</div>
Нет никаких упоминаний о том, что панели инструментов не исчезают при прокрутке.Это просто поведение в jQm.Плагины могут помочь с этим.