Оказалось, что человек, который первоначально внедрил систему, использовал различный бит кода для получения базового сценария для каждого модуля, поэтому мне пришлось пройтись и изменить каждый модуль.
Оказалось, что для административного модуля это связано с изменениями в том, как две разные версии php работают с путями.