Я установил Eclipse в / opt от имени пользователя root.У меня была именно эта проблема.
Кажется, это как-то связано с разрешениями (Да, я знаю, большое сообщение об ошибке).
Я просто установил плагины при запуске eclipse от имени пользователя root:
user@computer ~$ sudo eclipse &
Проблема решена!
РЕДАКТИРОВАТЬ: Вместо этого при установке вы можете изменитьвладение файлами eclipse, так что вам не нужно запускаться от имени суперпользователя каждый раз, когда вы хотите установить дополнение.
user@computer /opt $ sudo chown -R user eclipse/