Чтобы пользовательский элемент управления работал, вы должны разместить его на странице или каком-либо другом элементе управления. Я предлагаю вам загрузить свой пользовательский элемент управления в элемент управления сервером (как можно раньше в жизненном цикле элемента управления - возможно, OnInit), а затем в методе рендеринга элемента управления сервером, при необходимости, использовать вызов render элемента управления пользователя.