Использование скрытого поля будет вашим решением:
В javascript:
function SetValue()
{
$('#<%=Hidden1.ClientID%>').val() = "testing !!!!!";
}
И в html вам нужно это:
<input id="Hidden1" runat="server" type="hidden" value="" />
или это:
<asp:HiddenField ID="Hidden1" runat="server" Value="" />
И затем, поскольку ваше скрытое поле является сервером runat, вы можете получить к нему доступ в коде следующего поста назад.
Если вы не хотитедля обратной передачи вам может понадобиться webMethod