Просто установите шипы (и / или клещи), чтобы они были невидимыми.
* 1003 Е.Г. *
import matplotlib.pyplot as plt
fig, ax = plt.subplots()
ax.spines['right'].set_visible(False)
ax.spines['top'].set_visible(False)
plt.show()

Если вы хотите скрыть галочки сверху и слева, просто сделайте:
ax.xaxis.set_ticks_position('bottom')
ax.yaxis.set_ticks_position('left')
