Используйте <body onload="javascript:alert('hi its loaded. do what you want here');"> на своей HTML-странице, скажем myhtmlpage.html .
Затем используйте элемент управления XAML (<Frame Name="myWpfFrame" Source="http://myurl/myhtmlpage.html">) в вашем коде WPF.
Это решение будет работать при условии, что вы хотите вызывать javascript только один раз , и это будет только после страницы HTML.
Если вы хотите вызывать js более одного раза, вы можете установить исходное свойство элемента управления кадром из кода, как и когда вам нужно ... как в .. myWpfFrame.Source = myWpfFrame.Source;