Звучит так, будто вам просто нужно REPLACE
SQL> with x as (
2 select '123E4.00' str from dual
3 union all
4 select '123K5.00' from dual
5 union all
6 select '123K123' from dual
7 )
8 select replace( str, '.' )
9 from x;
REPLACE(
--------
123E400
123K500
123K123
Вам нужно превратить это в UPDATE
выражение для вашей таблицы
UPDATE some_table
SET some_column = REPLACE( some_column, '.' )
WHERE some_column != REPLACE( some_column, '.' )