Это может быть старый вопрос, но мое решение было следующим:
Я не хотел работать с .htaccess RewriteBase, так как этот же файл использовался в производственной среде, где RewriteBase нужно было бы изменить.
Вместо создания псевдонима Apache я создал символическую ссылку Windows.
Вместо директивы Apache
Alias /<alias> /<path>/<to>/<alias>/<dir>
Я зашел в текущий каталог webroot и создал
mklink /d <alias> /<path>/<to>/<alias>/<dir>
И не нужно изменять никакую другую конфигурацию (я не уверен, в какие разрешения попадают пути к каталогам).