Решение фактическое состоит в том, чтобы исправить ошибки и удалить операторы отладки, чтобы в журналах ничего не записывалось.Чтобы ответить на вопрос буквально, вы можете настроить обработчик ошибок , чтобы он ничего не регистрировал в core.php:
Configure::write('Error', array(
'handler' => 'ErrorHandler::handleError',
'level' => 0,
'trace' => false
));
Или, так как вы все равно запускаете задание cron каждые 2 минуты, удалите журналы одновременно.