Есть вероятность, что я неправильно понял вопрос, но я думаю, что вы хотели бы отключить список каталогов. Если это так, просто поставьте
Options -Indexes
в вашем файле .htaccess. Это говорит Apache не создавать этот модный список файлов при запросе URI http://example.com/directory/, поэтому пользователь получит ошибку 404. Запросы к файлам в каталоге не затрагиваются.
Вы также можете делать разные необычные вещи с помощью списка каталогов, используя директивы mod_autoindex , такие как IndexIgnore.