Вы можете общаться между Javascript и Actionscript через ExternalInterface.
В вашем случае: прослушайте конец флэш-фильма внутри вспышки и затем вызовите другой вызов метода javascript через ExternalInterface:
Во Flash:
addEventListener("finished", informJS);
private function informJS(e:Event) {
ExternalInterface.call("onFinish");
}
На вашей стороне Javascript вам нужен только метод "onFinish", который загружает следующий SWF.