Я помню похожую проблему, о которой сообщалось хотя бы один раз, однако пользователь не смог воспроизвести ее с новым проектом и не смог предоставить свой реальный проект, затронутый этой ошибкой.
Эта проблема, по-видимому, вызвана некоторой конкретной конфигурацией проекта, которая является очень необычной и поэтому не затрагивает большинство пользователей IDEA.
Если у вас есть воспроизводимый контрольный пример, сообщите об ошибке на YouTrack и прикрепите ваш проект к проблеме, чтобы мы могли ее исследовать и исправить.
P.S. также попробуйте IDEA 10.5.1, поскольку вы используете старую версию, обновление бесплатно для вас.