В зависимости от того, как вы задали вопрос, кажется, что вы плохо знакомы с написанием программного обеспечения для микроконтроллеров. Хотя для них существует .NET Micro Framework и поддерживается C #, общая концепция программирования микроконтроллеров сильно отличается от программирования приложений для настольных компьютеров. Если вы не готовы потратить некоторое время на изучение микроконтроллеров, я бы порекомендовал вам вместо этого использовать некоторую плату USB-реле и управлять реле прямо из настольного приложения C #, где вы чувствуете себя как дома.
Вы можете взглянуть на эту доску с примерами на C # или взглянуть на эту тему SOF, где похожие тема обсуждалась.