Агрегирование объекта зоопарка с метками времени по часам (т.е. не только по времени в объекте зоопарка) - PullRequest
3 голосов
/ 05 февраля 2012

У меня есть объект зоопарка, который состоит из временных рядов с метками времени.Временные ряды нерегулярны в том смысле, что временные интервалы между значениями не равномерно распределены.

Я хотел бы преобразовать нерегулярно разнесенный объект временных рядов в регулярно разнесенный, где временные интервалы между значениями постоянны, скажем15 минут, и это часы реального времени.

Некоторые примеры данных могут помочь проиллюстрировать

# Sample data
2011-05-05 09:30:04 101.32
2011-05-05 09:30:14 100.09
2011-05-05 09:30:19 99.89
2011-05-05 09:30:35 89.66
2011-05-05 09:30:45 95.16
2011-05-05 09:31:12 100.28
2011-05-05 09:31:50 100.28
2011-05-05 09:32:10 98.28

Я хотел бы объединить их (используя свою пользовательскую функцию) для каждой указаннойпериод времени (например, 30-секундный интервал времени), такой, что результат выглядит как таблица, представленная ниже.

Ключ в том, что я хочу агрегировать каждые 30 секунд по времени, а не по 30 секундам, начиная с моего первого времени наблюдения.Естественно, первый временной интервал будет первым временным интервалом, для которого у меня есть записанное наблюдение (т. Е. Строка) в агрегируемых данных.

2011-05-05 09:30:00   101.32
2011-05-05 09:30:30   89.66
2011-05-05 09:31:00   100.28

В данном примере моя пользовательская агрегатная функция просто возвращаетпервое значение в «наборе» из «выбранных строк» ​​для агрегирования.

Ответы [ 4 ]

5 голосов
/ 06 февраля 2012

Считайте данные и затем агрегируйте их по минутам:

Lines <- "2011-05-05 09:30:04 101.32
2011-05-05 09:30:14 100.09
2011-05-05 09:30:19 99.89
2011-05-05 09:30:35 89.66
2011-05-05 09:30:45 95.16
2011-05-05 09:31:12 100.28
2011-05-05 09:31:50 100.28
2011-05-05 09:32:10 98.28"

library(zoo)
library(chron)
toChron <- function(d, t) as.chron(paste(d, t))
z <- read.zoo(text = Lines, index = 1:2, FUN = toChron)
aggregate(z, trunc(time(z), "00:01:00"), mean)

Результат:

(05/05/11 09:30:00) (05/05/11 09:31:00) (05/05/11 09:32:00) 
             97.224             100.280              98.280 
2 голосов
/ 06 февраля 2012

Надеюсь, мы можем предположить, что это объект zoo или xts. Если так, то попробуйте это:

  # First get a start for a set of intervals, need to use your tz
beg<- as.POSIXct( format(index(dat[1,]), "%Y-%m-%d %H:%M", tz="EST5EDT"))
  # Then create a sequence of 30 second intervals
tseq <- beg+seq(0,4*30, by=30)
  # Then this will creat a vector than you can use for your aggregation fun
findInterval(index(dat), tseq)
  #[1] 1 1 1 2 2 3 4 5
  # To find the first row in a subset of rows from tapply, try "[" with 1
tapply(dat, findInterval(index(dat), tseq), "[", 1)
  #     1      2      3      4      5 
  #101.32  89.66 100.28 100.28  98.28 
1 голос
/ 06 февраля 2012

Я бы просто обрезал время до вашего интервала, поэтому предположим, что t - это время (используйте as.POSIXct, если это не так)

bucket = t - as.numeric(t) %% 30

тогда вы можете агрегировать по bucket, как aggregate(value, list(bucket), sum)

(я не использую zoo, так что это с чистым R)

0 голосов
/ 06 февраля 2012

Вы должны посмотреть на align.time в xts.Он делает нечто очень близкое к тому, чего вы хотите достичь.

my.data <- read.table(text="date,x
2011-05-05 09:30:04,101.32
2011-05-05 09:30:14,100.09
2011-05-05 09:30:19,99.89
2011-05-05 09:30:35,89.66
2011-05-05 09:30:45,95.16
2011-05-05 09:31:12,100.28
2011-05-05 09:31:50,100.28
2011-05-05 09:32:10,98.28", header=TRUE, as.is=TRUE,sep = ",")

my.data <- xts(my.data[,2],as.POSIXlt(my.data[,1],format="%Y-%m-%d %H:%M:%S"))

library(xts)
res <-align.time(my.data,30)
res[!duplicated(index(res)),]

                      [,1]
2011-05-05 09:30:30 101.32
2011-05-05 09:31:00  89.66
2011-05-05 09:31:30 100.28
2011-05-05 09:32:00 100.28
2011-05-05 09:32:30  98.28

Вы можете отставать от временного ряда на 30 секунд, если это делает интерпретацию более четкой.

...