Я использую коммерческий телефон на базе Android, благодаря чему я могу отправлять AT-команды с Hyper-терминала через мобильный USB-модем.
Попробуйте использовать pywinauto.Это позволит вам контролировать гипертерминал из окон.Другой вариант - использовать pySerial для прямой связи с последовательным портом.