Selenium не может контролировать подтверждение загрузки. Однако он может ввести путь к файлу непосредственно в поле загрузки файла, если вы используете «привилегированный» режим браузера для IE или Firefox. Если вы используете стандартные режимы * iexplore и * firefox с Selenium RC 1.0 beta 2, попробуйте просто ввести путь к файлу непосредственно в поле формы. Я делаю это сам, и это прекрасно работает.