Проверьте MIME-тип, который возвращает скрипт «file.ashx». Если это что-то отличное от application / pdf или отправка Content-Disposition, возможно, есть морщины.
В противном случае это может быть только (а) что-то странное в документе - другие документы загружаются нормально? - или (б) ваши настройки.
В любом случае, я бы лично не вставлял PDF-файл на веб-страницу. Плагин PDF - довольно неудобный способ просмотра документа, и плагин Adobe Reader, в частности, является исторически крайне ненадежным в IE, а также продолжающейся катастрофой безопасности. Я советую всем своим клиентам удалить его как можно скорее.