Вы можете создать новый класс и добавить эти объекты в класс, чтобы получить комбинированный объект.
class myXML {
function add($xmlobj) {
foreach ($xmlobj->children() as $key=>$obj) {
$this->$key = $obj;
}
}
}
$xob1 = simplexml_load_file($file1);
$xob2 = simplexml_load_file($file2);
$xob3 = new myXML();
$xob3->add($xob1);
$xob3->add($xob2);