Вот решение от группы пользователей scalatra
Добавить jetty-plus к зависимостям:
"org.eclipse.jetty" % "jetty-plus" % "7.4.5.v20110725" % "container"
Добавьте это к build.sbt:
env in Compile := Some(file(".") / "jetty-env.xml" asFile)
В том же каталоге, что и build.sbt, создайте файл jetty-env.xml:
<Configure class="org.eclipse.jetty.webapp.WebAppContext">
<Set name="contextPath">/foo</Set>
</Configure>